--- mapm/maps.c.orig 1993-02-09 16:35:03 UTC +++ mapm/maps.c @@ -592,7 +592,7 @@ MAP *map; clean_map(map); - fgetln(fp); + fgetln_(fp); if (!nstoken(&ln,sREQUIRED,name,NAME_LEN+1) || name[0]!='*' || sscanf(ln,"%d %d %d %d %lf",&num_loci,&unlink,&sex,&errors,&like)!=5) baddata("expected *chrom-name # # # #"); @@ -603,31 +603,31 @@ MAP *map; strcpy(map->map_name,name+1); map->allow_errors= errors; map->num_loci=num_loci; map->log_like=like; - fgetln(fp); + fgetln_(fp); for (i=0; ilocus[i]=num; } - fgetln(fp); + fgetln_(fp); for (i=0; irec_frac[i][MALE]=rnum; } if (raw.data_type==CEPH && sex) { - fgetln(fp); + fgetln_(fp); for(i=0; irec_frac[i][FEMALE]=rnum; } } else for (i=0; irec_frac[i][FEMALE]=0.0; - fgetln(fp); + fgetln_(fp); for(i=0; ifix_interval[i]=num; } @@ -637,7 +637,7 @@ MAP *map; matrix(map->error_lod,map->max_loci,raw.data.f2.num_indivs,real); } for (i=0; inum_loci; i++) { - fgetln(fp); + fgetln_(fp); if (!stoken(&ln,sREQUIRED,str) || !streq(str,"errors")) send(CRASH); if (!rtoken(&ln,rREQUIRED,&rnum)) send(CRASH); @@ -646,9 +646,9 @@ MAP *map; for(j=0; jerror_lod[i][j]= 0.0; } else { - fgetln(fp); + fgetln_(fp); for (j=0; jerror_lod[i][j]=rnum; }