--- hisat2.orig	2018-11-07 21:43:32 UTC
+++ hisat2
@@ -45,7 +45,7 @@ while (-f $prog && -l $prog){
 
 ($vol,$script_path,$prog) 
                 = File::Spec->splitpath($prog);
-my $os_is_nix   = ($^O eq "linux") || ($^O eq "darwin");
+my $os_is_nix   = ($^O ne "MSWin32") && ($^O ne "MSWin64");
 my $align_bin_s = $os_is_nix ? 'hisat2-align-s' : 'hisat2-align-s.exe'; 
 my $build_bin   = $os_is_nix ? 'hisat2-build' : 'hisat2-build.exe';               
 my $align_bin_l = $os_is_nix ? 'hisat2-align-l' : 'hisat2-align-l.exe';